L'EID a développé, depuis 1992, une activité de prestataire de service dans le domaine de la restauration des zones humides

Ces activités peuvent se regrouper en trois grands thèmes :
• la gestion des populations de ligneux par l'intermédiaire d'activités de bûcheronnage des arbres ou de broyage des arbustes
• la gestion des structures végétales herbacées par des pratiques de fauche dans des secteurs où des moyens mécaniques traditionnels ne pourraient pas intervenir (terrain peu portant, trop humide)
• le comblement de certains anciens réseaux de drains ou leur remplacement par des mares ou de petits étangs.

Ces activités permettent d'utiliser de manière complémentaire le personnel et le matériel de l'EID.

Le personnel module son emploi du temps en fonction des saisons. Les activités de démoustication se répartissent essentiellement durant la période printanière (du mois de mars à fin juillet) alors que les activités de restauration se déroulent en dehors des périodes de reproduction de la faune (du mois juillet à la fin de l'hiver).

Le matériel (broyeur chenillé, débroussailleuses et tronçonneuses) est utilisé pour la restauration des marais durant les périodes estivales et automnales alors que son utilisation hivernale permet la création ou l'entretien de passages d'accès pour le traitement des gîtes larvaires de moustiques.
Les pelles mécaniques servant autrefois à la création de réseaux de drainage sont utilisées aujourd'hui pour des activités de broyage ou de creusement de mares ou de comblement de fossés.

Par convention du 6 février 1985 signée avec le ministre de l'environnement représenté par le Préfet de l'Ain, l'E.I.D. a notamment été chargée de réaliser :

• les travaux de remise en état du site du marais de Lavours concerné par le classement en réserve naturelle
• les opérations nécessaires à la mise en valeur du site et à son entretien (acquisition, travaux, équipements, fonctionnement).

Le Marais de Lavours est un marais alcalin, le plus représentatif du rebord occidental des Alpes. Situé dans la région Rhône-Alpes où beaucoup de marais ont été asséchés depuis 20 ans, ce marais a pris une importance vitale pour certaines espèces migratrices, car il contient des biotopes qui se font de plus en plus rares.
La colonisation des espaces ouverts par les espèces arborées se traduit par une diminution des groupements végétaux typiques des zones humides qui conduit à une raréfaction et une banalisation de la faune et de la flore et donc de la biodiversité. Il est indispensable que le classement en réserve naturelle du marais s'accompagne d'une remise en état des biotopes. Les propositions de débroussaillage, de fauchage constituent un investissement de revalorisation du marais, auquel succède une mise en pâturage extensif par des bovins ou des équidés.
En outre, la création de plans d'eau permet de compenser pour partie la réduction des zones s'inondant régulièrement, d'offrir des habitats favorables aux oiseaux d'eau et de favoriser une faune liée aux eaux permanentes.

Une convention, signée le 18 juillet 1989 entre le Préfet de l'Ain, le Préfet de l'Isère, le Directeur régional de l'Office National des Forêts et le Président de l'Entente, a défini les activités de garderie qui sont les suivantes :
• veiller à l'application de la réglementation de l'arrêté interpréfectoral
• prendre en charge la surveillance et l'entretien des équipements spécifiques à la réserve pour la recherche scientifique et l'information du public
• assurer éventuellement les relevés d'appareils mis en place dans la réserve pour les études scientifiques.
Elle comporte également l'accompagnement des personnes concernées par l'intérêt scientifique, forestier ou pédagogique de la Réserve Naturelle Volontaire.

Dans le cadre de la création d'un réseau d'espaces naturels sensibles, le Département de l'Isère a fait appel à des compétences extérieures pour assurer l'équipement et la gestion de ces espaces. Pour la lône du Saugey, ancien méandre du Rhône, l'E.I.D. a été désigné comme opérateur gestionnaire de ce site en 2000.